Ocean-wide comparisons of mesopelagic planktonic community structures
Janaina Rigonato
(1, 2, 3, 4, 5)
,
Marko Budinich
(6, 7, 8)
,
Alejandro Murillo
(9)
,
Manoela Brandão
(10, 11, 12)
,
Juan Pierella Karlusich
(13)
,
Yawouvi Dodji Soviadan
(10, 11, 12)
,
Ann Gregory
(14)
,
Hisashi Endo
(15)
,
Florian Kokoszka
(13, 16)
,
Dean Vik
(14)
,
Nicolas Henry
(6, 7, 3)
,
Paul Frémont
(1, 2)
,
Karine Labadie
(1, 2)
,
Ahmed Zayed
(14)
,
Céline Dimier
(10, 11, 12)
,
Marc Picheral
(10, 11, 3)
,
Sarah Searson
(10, 11, 12)
,
Julie Poulain
(3, 1, 2)
,
Stefanie Kandels
(9, 17)
,
Stéphane Pesant
(18)
,
Eric Karsenti
(13, 17)
,
Chris Bowler
(3, 13)
,
Colomban de Vargas
(6, 7, 3)
,
Damien Eveillard
(3, 8)
,
Marion Gehlen
(19, 20)
,
Daniele Iudicone
(16)
,
Fabien Lombard
(10, 11, 12)
,
Hiroyuki Ogata
(15)
,
Lars Stemmann
(12, 11, 10, 3)
,
Matthew Sullivan
(14)
,
Shinichi Sunagawa
(17, 21)
,
Patrick Wincker
(3, 2, 1, 4)
,
Samuel Chaffron
(3, 8)
,
Olivier Jaillon
(2, 1, 3, 4, 5)
1
JACOB -
Institut de Biologie François JACOB
2 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
3 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
4 UMR 8030 - Génomique métabolique
5 LAGE - Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
6 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
7 ADMM - Adaptation et diversité en milieu marin
8 LS2N - Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes
9 EMBL - European Molecular Biology Laboratory [Heidelberg]
10 IMEV - Institut de la Mer de Villefranche
11 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
12 SU - Sorbonne Université
13 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
14 OSU - The Ohio State University [Columbus]
15 KUICR - Institute for Chemical Research, Kyoto University
16 SZN - Stazione Zoologica Anton Dohrn
17 EMBL Heidelberg
18 Universität Bremen [Deutschland] = University of Bremen [Germany] = Université de Brême [Allemagne]
19 LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette]
20 MERMAID - Modelling the Earth Response to Multiple Anthropogenic Interactions and Dynamics
21 SIB - Swiss Institute of Bioinformatics
2 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
3 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
4 UMR 8030 - Génomique métabolique
5 LAGE - Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
6 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
7 ADMM - Adaptation et diversité en milieu marin
8 LS2N - Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes
9 EMBL - European Molecular Biology Laboratory [Heidelberg]
10 IMEV - Institut de la Mer de Villefranche
11 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
12 SU - Sorbonne Université
13 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
14 OSU - The Ohio State University [Columbus]
15 KUICR - Institute for Chemical Research, Kyoto University
16 SZN - Stazione Zoologica Anton Dohrn
17 EMBL Heidelberg
18 Universität Bremen [Deutschland] = University of Bremen [Germany] = Université de Brême [Allemagne]
19 LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette]
20 MERMAID - Modelling the Earth Response to Multiple Anthropogenic Interactions and Dynamics
21 SIB - Swiss Institute of Bioinformatics
Manoela Brandão
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1344803
- IdHAL : manoela-brando
Juan Pierella Karlusich
- Fonction : Auteur
- PersonId : 816726
- ORCID : 0000-0003-1739-4424
Hisashi Endo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 792600
- ORCID : 0000-0003-0016-1624
Nicolas Henry
- Fonction : Auteur
- PersonId : 751540
- IdHAL : nicolas-henry
- ORCID : 0000-0002-7702-1382
- IdRef : 196940427
Paul Frémont
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1168861
- ORCID : 0000-0001-6934-3018
- IdRef : 267243456
Karine Labadie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757912
- ORCID : 0000-0001-7467-8509
- IdRef : 089020235
Ahmed Zayed
- Fonction : Auteur
- PersonId : 798705
- ORCID : 0000-0003-2793-2679
Julie Poulain
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756903
- IdHAL : julie-poulain
- ORCID : 0000-0002-8744-3116
- IdRef : 061407232
Chris Bowler
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1228231
- IdHAL : chris-bowler
- ORCID : 0000-0003-3835-6187
- IdRef : 06874904X
Colomban de Vargas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1196134
- IdHAL : colomban-de-vargas
- ORCID : 0000-0002-6476-6019
- IdRef : 144372401
Damien Eveillard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 95
- IdHAL : damien-eveillard
- ORCID : 0000-0002-8162-7360
- IdRef : 080211542
Marion Gehlen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756723
- ORCID : 0000-0002-9688-0692
- IdRef : 160349362
Daniele Iudicone
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757541
- ORCID : 0000-0002-7473-394X
- IdRef : 139806903
Fabien Lombard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 8141
- IdHAL : fabien-lombard
- ORCID : 0000-0002-8626-8782
- IdRef : 108028747
Hiroyuki Ogata
- Fonction : Auteur
- PersonId : 755567
- ORCID : 0000-0001-6594-377X
Lars Stemmann
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762924
- IdHAL : lars-stemmann
- ORCID : 0000-0001-8935-4531
- IdRef : 157238024
Matthew Sullivan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766100
- ORCID : 0000-0001-8398-8234
Shinichi Sunagawa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1166109
- ORCID : 0000-0003-3065-0314
Patrick Wincker
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757160
- IdHAL : patrick-wincker
- ORCID : 0000-0001-7562-3454
Samuel Chaffron
- Fonction : Auteur
- PersonId : 12266
- IdHAL : samuel-chaffron
- ORCID : 0000-0001-5903-617X
- IdRef : 224068989
Olivier Jaillon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756900
- IdHAL : olivier-jaillon
- ORCID : 0000-0002-7237-9596
- IdRef : 119733374
Résumé
For decades, marine plankton have been investigated for their capacity to modulate biogeochemical cycles and provide fishery resources. Between the sunlit (epipelagic) layer and the deep dark waters, lies a vast and heterogeneous part of the ocean: the mesopelagic zone. How plankton composition is shaped by environment has been well-explored in the epipelagic but much less in the mesopelagic ocean. Here, we conducted comparative analyses of trans-kingdom community assemblages thriving in the mesopelagic oxygen minimum zone (OMZ), mesopelagic oxic, and their epipelagic counterparts. We identified nine distinct types of intermediate water masses that correlate with variation in mesopelagic community composition. Furthermore, oxygen, NO 3 − and particle flux together appeared as the main drivers governing these communities. Novel taxonomic signatures emerged from OMZ while a global co-occurrence network analysis showed that about 70% of the abundance of mesopelagic plankton groups is organized into three community modules. One module gathers prokaryotes, pico-eukaryotes and Nucleo-Cytoplasmic Large DNA Viruses (NCLDV) from oxic regions, and the two other modules are enriched in OMZ prokaryotes and OMZ pico-eukaryotes, respectively. We hypothesize that OMZ conditions led to a diversification of ecological niches, and thus communities, due to selective pressure from limited resources. Our study further clarifies the interplay between environmental factors in the mesopelagic oxic and OMZ, and the compositional features of communities.
| Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
|---|
